跨境店指人在大陆境内申请的店铺，本土店是指由本地人手机号和银行卡开设的店铺。当然现在市场上很多本土店也都是中国人在境内进行运实际运营的，本土店是可以用买的。两个区别是：
一、收费不一样
跨境店铺收佣金6%，本土店不用收佣金。两者都要收交易手续费2%
二、运送方式不一样
跨境店走的都是官方的物流。本土店国内端头程是可以任意选择，然后交给当地指定的派送商进行派送。
三、可经营类目不一样
跨境会有较多的限制类目，比如液体，电子产品（纯电池类），粉末状等类目不让上架。本土店就没有限制
四、回款速度不一样
本土店是买家确认收货后就可以马上提现。跨境店是需要等待虾皮每个月两次的拨款。
本土店虽然受官方流量扶持倾斜，但是现在官方审核越来越严格，会有一定的封号风险，并且对于“假本土”，官方也是能识别出来，流量会优先给真正本地人开设的店铺。